吉安县二中的前身是吉安县敦厚镇中学，创建于1982年，当时是一所初级中学，1991年扩建成完全中学，更名为吉安县敦厚中学。2001年被省教育厅确定为“江西省重点建设学校”，被市教育局确定为“吉安市重点中学”，2004年完成了初中部剥离工作，同年经市政府批准更名为“吉安县第二中学”。
吉安县二中坐落在县城美丽的君山湖畔，毗邻宽阔笔直的君山大道，交通便利，环境幽雅，人杰地灵，是莘莘学子理想的求学之所。
学校本着“面向全体学生，为学生终身发展奠基”的教学宗旨，以“团结、勤奋、求实、创新”为校训，确立了“关注尖子生，重视普通生，促进潜能生”的“三生”教育理念，始终不渝走“现代化、高质量、有特色”发展之路。
学校始终把德育工作摆在首要位置。政工处、团委、年级组、班集体构成了“三层四线”德育工作网络。始终贯穿“人人讲德育，岁岁有主题”的德育思路，根据不同形势，对学生进行爱国主义教育、集体主义、文明礼仪、自强不息理想、诚信、感恩教育;充分挖掘德育资源，开展形式多样课余活动，寓教于乐;发挥文化育人作用，利用一报(《吉安县二中校报》)、一站(“校园之声”广播站)、一社(《君山文学社》)、一栏(文化长廊宣传栏)、一晨(每周一早晨升国旗)对学生进行潜移默化的教育。党总支坚持开展“抓党建，促治校”活动，不断培养教师的“五种精神”：求真务实的科学精神、敬业爱岗的奉献精神、与时俱进的创新精神、艰苦奋斗的拼搏精神、忠于职守的负责精神。
为丰富师生课余生活，充分发挥学校体艺优势，扩大学校影响，学校先后投入资金300多万元，用于体育场地、设施建设、维护和体育器材设备添置，先后制定了《吉安县第二中学体育传统项目发展规划》、《体育教师考评制度》等10余种制度，成立了竞技体训队、高考体训队、舞蹈队、器乐队等体艺小组，实行管理“三负责”、训练“四确定”的模式，最大限度地挖掘学生的体艺潜能。
“以质量立校”是学校的奋斗目标和执着追求。举全校之力，突出教学中心地位。学校以常规教学为主线，以研、课改为突破口，落实“一年级打基础，二年级防分化，三年级抓提高”的教育教学规律。抓紧常规教育学中备课、上课、作业、辅导和检测“五环节”，向45分钟要质量。贯彻“因材施教”的教学原则，成立了奥赛辅导小组、培优治拐指导小组、学生社会调查兴趣小组等10余个小组，开展了丰富彩的兴趣小组活动;强调全体教师牢固树立“民主合作”的教学观，发挥备课组、教研组集体才智;在全校师生中倡导五种风气：严谨的教学风气、自觉的学习风气、诚信的考试风气、躬行的实验风气、浓郁的著述风气。
十多年来，学校勇于开拓，不断创新，建立和完善了一套科学实验、民主、务实的管理体系。从管理中提升学校品位，从管理中提高学校的质量和效益，形成了富有特色的学校管理方略。一是管理制度化。“依法治校，制度管理”，学校先后建立和完善了30余项管理制度。二是管理民主化。坚持每年一次教代会制度，畅通民主渠道;坚持每月一次教工民主生活会，采纳教师的合理化建议，坚持校务公开，接受民主监督。三是管理社会化。学校与当地派出所建立了治安联防制度，聘请公检法部门到校举办法制报告会，成立了家长委员会，广泛听取家长、社会对学校办学的意见和建议，建立“学校、家庭、社会”三位一体的学校教育工作网络。
学校本着“一心一意抓教育，千方百计求发展”的办学思路，严格教育管理，全面开展素质教育，教研教改氛围浓厚，有多个已立项的国家、省、市级课题，还有一批论文在各级刊物上发表，在省市优质课比赛中，也取得好成绩，先后有7人获省市级奖，在学科竞赛中，先后有十多位同学在各类竞赛中获得国家级、省级奖励。高考成绩骄人，上线率，录取率稳步提高，在市重点高中名列前茅，作为“田径传统项目学校”，连续三年获全省传统项目田径比赛团体总分第一名，文艺汇演多次获省、市团体总分第一名，多个单项节目获省、市级奖，春风化雨，德育为先，我校学生素质显著提高，每年都有一批学生获得省、市、县优秀“三好学生”“优秀班干”“优秀团干”称号。
学校现有教学班级60个，在校学生3600余人。现有教职工228人，其中专任教师199人，研究生学历29人，本科学历178人，学历达标率94%，特级教师1人，高级教师57人，一级教师88人，一级教师88人，特级教师1人，市级学科带头人2人，县学科带头人16人。学校教师以中青年为主，他们朝气蓬勃，锐意创新，奋发进取，师德水平高，敬业精神强，教学业务精，是一支德艺双馨的高素质队伍。
