云南农业大学总共有73个专业。
云南农业大学本科专业有65个:电气工程及其自动化、
建筑环境与设备工程、风景园林、农业水利工程、森林资源保护与游憩、土木工程(高职本科)、草业科学、农业建筑环境与能源工程、给排水科学与工程、农业机械化及其自动化、建筑环境与能源应用工程、食品质量与安全、烟草、种子科学与工程、食品科学与工程、中草药栽培与鉴定、茶学、蚕学、食品科学与工程(蜂学及蜂产品加工方向)、茶学(茶艺茶道方向)、机械设计制造及其自动化、车辆工程、农学、水利水电工程、土木工程、植物保护、园林(高尔夫球场管理方向)、电子信息工程、网络工程、水土保持与荒漠化防治、农业资源与环境、计算机科学与技术、动物科学、园林、动物科学(饲料科学与工程方向)、动物医学、工业工程、秘书学、动物医学(动物检疫方向)、数学与应用数学、信息管理与信息系统、水产养殖学、农村区域发展、资源环境与城市规划管理、园艺、农林经济管理、园艺(中荷交流项目)、农林经济管理(特有民族班)、环境科学、设施农业科学与工程、人文地理与城乡规划、电子商务、蜂学、生物技术、土地资源管理、森林保护与游憩、资源环境与城乡规划管理、社会工作、经济学、动植物检疫(植物检疫方向)、旅游管理、应用化学、社会体育指导与管理、英语、体育教育。
云南农业大学其他专业有8个:能源与动力工程、越南语、公共事业管理、工程管理、工程造价、建筑学、环境工程、行政管理。