成都中医药大学总共有44个专业。
成都中医药大学本科专业有37个：中医学（五年）、中药学（基地班）、应用心理学、制药工程、生物科学、药物制剂、生物技术、食品质量与安全、临床医学、医学信息工程、康复治疗学、临床医学（定向）、中药资源与开发、市场营销、中医学、藏药学、公共事业管理、预防医学、工商管理、汉语国际教育、运动康复、体育教育、中医学吴棹仙班、医学检验技术、针灸推拿学、社会体育指导与管理、食品卫生与营养学、中西医临床医学（五年）、中西医临床医学、中医学（定向）、护理学、卫生检验与检疫、药学、英语、中药学、藏医学（五年）、日语。
成都中医药大学专科专业有6个：旅游管理、护理、卫生检验与检疫技术、心理咨询（境外合作项目）、医学检验技术（专科）、临床医学（对口高职）。
成都中医药大学其他专业有1个：康复治疗技术（中美合作办学）。
