四川农业大学总共有78个专业。
四川农业大学本科专业有70个:制药工程、食品科学与工程、食品质量与安全、生物医学工程、生物工程、药学、中草药栽培与鉴定、药物制剂、计算机科学与技术、农业机械化及其自动化、环境工程、农业电气化与自动化、农业
建筑环境与能源工程、森林工程、木材科学与工程、农业水利工程、植物科学与技术、草业科学类(中外合作办学)、
财务管理、社会体育、土木工程、野生动物与自然保护区管理、种子科学与工程、资源环境与城乡规划管理、园林、人力资源管理、地理信息系统、动物科学、环境生态、土建、动物医学、旅游管理、生态学、城市规划、水产养殖学、烟草、土地资源管理、农业资源与环境、经济学、农林经济管理、生物技术、林学、农村区域发展、国际经济与贸易、生物科学、电子商务、水利水电工程、金融学、森林资源保护与游憩、信息管理与信息系统、法学、动植物检疫、工商管理、社会工作、水土保持与荒漠化防治、教育技术学、环境科学、市场营销、信息与计算科学、农学、化学生物学、园艺、植物保护、茶学、草业科学、应用化学、应用物理学、广告学、英语、汉语言文学。
四川农业大学其他专业有8个:思想政治教育、景观建筑设计、工程造价、设施农业科学与工程、应用生物科学、工程管理、政治学与行政学、包装工程。