重庆医科大学总共有32个专业。
重庆医科大学本科专业有30个:中药学、临床医学专业(本硕连读)(硕士段培养方向:儿科医学)、临床医学(本硕连读)、医学实验技术、基础医学、针灸推拿学、预防医学、临床医学专业(本硕连读)(硕士段培养方向:微创无创治疗)、口腔医学技术、生物医学工程、临床医学、信息管理与信息系统、麻醉学、生物信息学、医学影像学、公共事业管理、生物技术、口腔医学、护理学、中医学、临床药学、法医学、药物制剂、药学、应用心理学、康复治疗学、应用统计学、食品卫生与营养学、卫生检验与检疫、英语。
重庆医科大学专科专业有2个:临床医学(专科)、护理。