肇庆学院总共有68个专业。
肇庆学院本科专业有67个：历史学（师范）（本科）、电气工程及其自动化（本科）、生物技术（食品药品技术与营销）(本科)、生物技术（食品营养与检测）(本科)、物联网工程（本科）、网络工程（本科）、统计学（本科）、行政管理（基层政务）（本科）、生物教育（师范）(专科)、生物科学（食品卫生安全）(本科)、通信工程（本科）、投资学（本科）、旅游管理（国际旅游）（本科）、食品科学与工程（本科）、英语教育（师范）（专科）、
会计学（本科）、计算机科学与技术（本科）、教育技术学（数字媒体，师范）（本科）、视觉传达设计（本科）、环境设计（本科）、国际经济与贸易（本科）、法学（卓越律师实验班）（本科）、学前教育（师范）（本科） 、化学（现代分析与测试技术）（本科）、软件工程（本科）、音乐教育（学前
艺术教育，师范）（专科）、思想政治教育（卓越教师实验班）（本科）、化学（精细化工）(本科)、机械设计制造及其自动化（本科）、旅游管理（会展与策划）（本科）、法学（金融法）（本科）、音乐学（师范）（本科）、环境工程（环境监测与治理技术）(本科)、酒店管理（本科）、体育教育(师范）（本科）、应用心理学（师范）（本科）、市场营销（本科）、电子信息科学与技术（本科）、社会体育指导与管理（本科）、产品设计（本科）、政治学与行政学（公务员）（本科）、人力资源管理（本科）、初等教育（师范）（专科）、数学与应用数学（师范）（本科）、物理学（光电子信息、物理教育，师范）（本、学前教育（师范）（专科）、行政管理（应急管理）（本科）、小学教育（小学语文，师范）（本科）、数学与应用数学（金融数学）（本科）、信息与计算科学（本科）、生物科学（师范）（本科）、园林（城市景观规划与设计）(本科)、书法学（师范）（本科）、园林（园林工程与设计）(本科)、制药工程（药物制剂与营销）(本科)、日语（外贸）（本科） 、工艺美术（本科）、汉语言文学（师范）（本科）、音乐表演（师范）（本科）、汉语言文学（高级秘书）（本科）、广播电视学（本科）、英语（翻译）（本科） 、英语（外贸）（本科） 、汉语国际教育（本科）、舞蹈学（师范）（本科）、美术学（国画、油画、装饰艺术，师范）（本科）、动画（本科)。
肇庆学院专科专业有1个：语文教育（师范）（专科）。
