吉首大学总共有55个专业。
吉首大学本科专业有47个：食品科学与工程、人力资源管理、法学、历史学、生物工程、信息管理与信息系统、思想政治教育、网络工程、临床医学、小学教育、城市规划、护理学、食品质量与安全、针灸推拿学、信息与计算科学、植物科学与技术、工商管理、园林、电子信息科学与技术、国际经济与贸易、电子信息工程、市场营销、数学与应用数学、经济学、
会计学、经济学、计算机科学与技术、物理学、通信工程、旅游管理、化学、环境工程、公共事业管理、应用化学、电子商务、化学工程与工艺、生物科学、文化产业管理、法学、环境科学、资源环境与城乡规划管理、英语、日语、外国语言文学、汉语言文学、新闻学、广告学。
吉首大学其他专业有8个：软件工程、学前教育、土木工程、材料科学与工程、制药工程、医学影像学、教育技术学、统计学。
