武汉工程大学总共有86个专业。
武汉工程大学本科专业有81个：药物制剂、药物制剂、矿物加工工程、采矿工程、食品科学与工程、矿物加工工程、通信工程、生物工程、石油工程、法学、无机非金属材料工程、资源勘查工程、国际经济与贸易、理论与应用力学、行政管理、智能科学与技术、计算机科学与技术、信息与计算科学、软件工程、网络工程、高分子材料与工程、工业设计、应用化学、机械设计制造及其自动化、材料科学与工程、城市规划、生物技术、材料成型及控制工程、
建筑学、土木工程、过程装备与控制工程、飞行器设计与工程、环境工程、信息管理与信息系统、测控技术与仪器、印刷工程、安全工程、热能与动力工程、光信息科学与技术、环境监察、自动化、交通运输、工程管理、材料物理、化学工程与工艺、材料化学、电子信息工程、制药工程、数学与应用数学、工商管理、英语、市场营销、
会计学、电子商务、公共事业管理、广告学、法学类、护理学类（中外台作办学）、对外汉语、测绘类、海洋工程类（中外合作办学）、工商管理类、护理学类（中外合作办学）、计算机类、机械工程、化工与制药类、地理信息科学、矿业类、材料类、环境科学与工程类、机械类、生物科学类、仪器仪表类、药学类(中外合作办学)、电气类、海洋工程类、汉语国际教育、经济与贸易类、土木类、海洋科学类、土建类。
武汉工程大学其他专业有5个：化工与制药、道路桥梁与渡河工程、经济学、材料、电气工程及其自动化。
