南昌工程学院总共有49个专业。
南昌工程学院本科专业有37个：给排水工程技术、自动化、水土保持与荒漠化防治、信息管理与信息系统、
建筑工程技术、园林、电气工程及其自动化、城镇规划、信息与计算科学、电子信息工程、水利水电工程、国际经济与贸易、测绘工程、英语、计算机科学与技术、水文与水资源工程、广播电视新闻学、工程管理、车辆工程、
财务管理、给水排水工程、土木工程、机械设计制造及其自动化、工程测量技术、建筑环境与设备工程、工程造价、水利水电建筑工程、城市规划、通信工程、材料成型及控制工程、机械电子工程、市场营销、水文与水资源、物流管理、热能与动力工程、旅游管理、电子商务。
南昌工程学院专科专业有3个：道路桥梁工程技术、建筑装饰工程技术、园林技术。
南昌工程学院其他专业有9个：软件工程、地质工程、农业水利工程、编辑出版学、保险、法语、测控技术与仪器、电气信息、道路桥梁与渡河工程。
