赣南医学院总共有32个专业。
赣南医学院本科专业有23个：临床医学(医事法学方向)、医学检验技术、口腔医学、生物医学工程、麻醉学、制药工程、护理学、公共事业管理、临床医学(医学心理学方向)、法学、药学、运动人体科学、康复治疗学、法医学、应用心理学、生物技术、中药学、医学影像技术、英语、临床医学(中西医结合临床方向)、预防医学、运动康复、临床医学。
赣南医学院专科专业有9个：医药营销、
艺术设计、应用英语、护理（专科）、临床医学（专科）、药学(专科)、护理（涉外护理方向）、医学检验技术（专科）、医疗器械制造与维护（专科）。
