中国科学技术大学总共有41个专业。
中国科学技术大学本科专业有39个:机械设计及其自动化国防生、管理科学与工程、生物科学、生物科学、热能与动力工程、力学基地班、地球物理学、数学与应用数学国防生、力学、物理学、能源动力系统及自动化国防生、生命科学与技术基地班、材料化学、物理学国防生、传播学、电子信息科学类国防生、化学、地球化学、理科试验班、英语、数学、工程力学国防生、地理物理系国防生、电子信息科学、材料科学与工程、理论与应用力学、工程力学定向生、复合材料与工程、电子信息科学与技术、安全工程、材料科学、物理学、机械设计制造及其自动化、核工程与核技术、材料学、化学、能源动力、环境科学、管理科学。
中国科学技术大学其他专业有2个:计算机科学与技术、环境科学。