南京铁道职业技术学院总共有23个专业。
南京铁道职业技术学院专科专业有20个：铁道交通运营管理(城市轨道交通运营管理)、软件技术(WEB应用开发)、
会计(注册会计师、施工会计、信息管理技术)、软件技术(微软嵌入式)、市场营销(客运营销、商业连锁)、旅游管理(出境领队、
铁路旅游)、商务日语、环境
艺术设计(室内、景观)、物流管理(国际物流、铁路物流、3+2游学制)、电气自动化技术、国际商务(中美合作)、铁道机车车辆、电气化铁道技术、国际商务(海外本科直通车)、铁道工程技术、广告设计与制作、铁道通信信号(轨道通信)、电子信息工程技术、动漫设计与制作、软件技术(移动智能应用开发)。
南京铁道职业技术学院其他专业有3个：高速动车组检修技术、数字媒体设计与制作、高速铁路动车乘务。
