南京工业大学总共有78个专业。
南京工业大学本科专业有76个：无机非金属材料工程、制药工程、高分子材料与工程、食品科学与工程、生物工程、复合材料与工程、计算机科学与技术、机械设计制造及其自动化、过程装备与控制工程、
建筑学、建筑环境与设备工程、给水排水工程、消防工程、环境工程、药物制剂、安全工程、安全防范工程、药学、冶金工程、机械工程及自动化、测控技术与仪器、热能与动力工程、电子信息工程、通信工程、轻化工程、金融学、公共事业管理、应用物理学、土木工程、城市地下空间工程、法学、化学、化学工程与工艺、社会工作、工商管理、工业设计、应用化学、信息管理与信息系统、生物工程、勘查技术与工程、生物科学、市场营销、生物技术、生命科学与技术基地班、给排水科学与工程、金属材料工程、水质科学与技术、工业工程、地理信息系统、电气工程及其自动化、工程管理、统计学、材料科学与工程、自动化、
会计学、生物学基地班、资源环境与城乡规划管理、城市规划、电子商务、光电子材料与器件、信息与计算科学、行政管理、测绘工程、电子信息科学与技术、人力资源管理、交通工程、数学与应用数学、建筑节能技术与工程、材料物理、国际经济与贸易、生态学、材料化学、环境科学、英语、德语、日语。
南京工业大学其他专业有2个：车辆工程、风能与动力工程。
