南京农业大学总共有64个专业。
南京农业大学本科专业有64个:中药学、食品质量与安全、植物保护、水产养殖学、旅游管理、机械设计制造及其自动化、生物工程、草业科学、种子科学与工程、电子商务、园林、机械成型及控制工程、国际经济与贸易、农业机械化及其自动化、农业资源与环境、工业设计、农业电气化与自动化、金融学、动物科学、材料成型及控制工程、自动化、动物医学、行政管理、信息管理与信息系统、水产养殖业、计算机科学与技术、工业工程、动物医学、公共事业管理、环境工程、设施农业科学与工程、劳动与社会保障、工商管理、交通运输、动物药学、网络工程、土地资源管理、物流工程、市场营销、农林经济管理、
会计学、农村区域发展、食品科学与工程、车辆工程、人力资源管理、工程管理、法学、景观学、农学、园艺、社会学、生物科学与生物技术、生命科学与技术基地班、应用化学、生物学基地班、资源环境与城乡规划管理、英语、日语、电子信息科学与技术、环境科学、生态学、统计学、生物技术、生物科学。