齐齐哈尔工程学院总共有42个专业。
齐齐哈尔工程学院本科专业有19个：车辆工程专业、计算机科学与技术（软件工程）、护理学、土木工程专业、计算机科学与技术（物联网工程）、风景园林、机械设计制造及其自动化、
财务管理专业、计算机科学与技术、电子商务专业、
汽车服务工程、电气工程及其自动化、交通运输、英语、工程管理、环境设计、视觉传达设计（动画与游戏美术）、材料成型及控制工程专业、视觉传达设计(平面与广告设计)。
齐齐哈尔工程学院专科专业有23个：食品营养与检测、
建筑工程技术、社会工作、工程测量技术、道路桥梁工程技术、物流管理、工程机械运用与维护、市场营销、电气自动化、数控技术（设备升级改造）、机械制造与自动化、汽车整形技术、动漫设计与制作、计算机应用技术、汽车检测与维修技术、应用电子技术、软件技术（北大青鸟软件工程师）、汽车技术服务与营销、环境
艺术设计、汽车电子技术、工程造价、机电一体化、家具设计与制造。
