吉林工商学院总共有44个专业。
吉林工商学院本科专业有29个：生物工程、机械电子工程、
财务管理、食品科学与工程、
会计学、人力资源管理、网络工程、粮食工程、动物科学、工程管理、国际经济与贸易、机械设计制造及其自动化、审计学、英语（经贸英语）、财政学、动画、经济学、电子信息工程、金融学、广告学、计算机科学与技术、食品质量与安全、日语、食品营养与检验教育、旅游管理、烹饪与营养教育、工商管理、过程装备与控制工程、市场营销。
吉林工商学院专科专业有13个：食品加工技术、国际贸易实务、会计、物业管理、资产评估与管理、金融管理与实务、物流管理、新闻采编与制作、计算机网络技术、烹饪工艺与营养、酒店管理、商务英语、商务日语。
吉林工商学院其他专业有2个：税务、保险。
