内蒙古农业大学总共有80个专业。
内蒙古农业大学本科专业有79个：软件工程（英汉双语授课）、食品科学与工程、材料科学与工程、包装工程、机械设计制造及其自动化、食品质量与安全、计算机科学与技术（英汉双语授课）、生物工程、工业设计、农业电气化与自动化、农业机械化及其自动化、电气工程及其自动化、测绘工程、木材科学与工程（含家具设计方向、木结构
建筑方向）、水利类(英汉双语授课)、土木工程、交通工程、网络工程（英汉双语授课）、水文与水资源工程、森林工程（公路工程机械方向）、农业水利工程、环境工程、交通运输、制药工程、新能源科学与工程、水土保持与荒漠化防治、草业科学（含草坪和药用植物方向，英汉双语授课）、农林经济管理（含畜牧业经济方向）、化学工程与工艺、动物药学、
服装设计与工程、电子科学与技术、农业资源与环境、园艺（含观赏园艺方向，英汉双语授课）、植物保护（含植物检疫方向）、园林、金融学(英汉双语授课)、消防工程、行政管理（农村发展与管理方向）、动物医学（马兽医方向）、建筑学、物流管理、经济学（贸易经济方向）、道路桥梁与渡河工程、园林(双语教学试点班)、动物医学（国家第二类特色专业）、信息管理与信息系统、
会计学、动物医学、动物科学（动物营养方向，英汉双语授课）、人文地理与城乡规划、工商管理、水产养殖学、法学、植物科学与技术、动物科学、法学（英汉双语授课）、动物生产类（教改试点专业）、电子商务、水利水电工程、动植物检疫（动物方向）、社会工作、地质工程、种子科学与工程、生物科学（含英汉双语授课）、农学（含英汉双语授课）、设施农业科学与工程、行政管理、车辆工程（英汉双语授课）、应用化学、土地资源管理、给排水科学与工程、林学、生物技术（含英汉双语授课）、应用统计学、英语、森林保护、城乡规划、设计学类（含环视觉传达设计，环境设计，产品设计专业）。
内蒙古农业大学其他专业有1个：运动马驯养与管理。
